如果搬家公司员工搬家后肌肉酸疼，可以采取以下措施缓解疼痛：

1. 休息：让身体得到充分的休息，避免过度运动。

2. 热敷：使用热水袋或热毛巾敷在疼痛的部位，可以缓解肌肉酸疼。

3. 按摩：轻轻按摩疼痛的部位，可以促进血液循环，缓解肌肉酸疼。

4. 拉伸：进行适当的拉伸运动，可以缓解肌肉酸疼。

5. 疼痛药物：如果疼痛严重，可以使用非处方疼痛药物缓解疼痛。

如果疼痛持续时间较长或疼痛严重，建议及时就医。